Из запланированных восьми томов собрания церковно-исторических трудов историка церкви, преподавателя Санкт-Петербургской духовной академии профессора Василия Васильевича Болотов вышло 4 тома.
В первый том вошла его магистерская диссертация, защищенная им в 1879 г. после окончания церковно-исторического отделения Санкт-Петербургской Духовной академии. Название диссертации «Учение Оригена о Святой Троице» было предложено профессором И.В. Чельцовым. Эта диссертация достаточно значима для отечественных исследований в области философии религии и философской антропологии. В этот том также вошли и ранее не публиковавшиеся студенческие работы Болотова: «О различии между религиозным, нравственным и эстетическим чувством», «На чем основывается учение о наследственности таланта», «Пифагор в представлении Порфирия» и др.
Во второй, третий и четвертый тома собрания церковно-исторических сочинений вошли лекции Болотова по истории древней церкви (включая период Вселенских соборов), которые он читал студентам Санкт-Петербургской духовной академии. Частично эти материалы были опубликованы А. И. Бриллиантовым еще в 1907 г., но новое издание было исправлено и дополнено хранившимися в архиве и ранее не публиковавшимися материалами лекций. Также в четвертом томе были опубликованы «Заметки по истории христианского монашества» - фрагменты лекций Болотова о раннем христианском монашестве с историографическим введением («Протестантская историография»). Любопытно, что специфику египетского монашества исследователь пытался связать с особенностями менталитета коптов, и посвятил этому вопросу отдельную лекцию «Национальный характер коптов и особенности египетского аскетизма».